Drzewa liściaste i iglaki często narażone są na rdze, plamistość liści i igieł, zamieranie pędów czy zgnilizny. Dlatego zapobieganie chorobom drzew wymaga stosowania różnych środków i zabiegów, najlepiej jak najbardziej ekologicznych.
Szkółka roślin w okolicach Skawiny, która zajmuje się doradztwem przy zakładaniu ogrodów radzi, aby jeszcze przed zakupem drzewa sprawdzić, czy poszczególny egzemplarz nie nosi śladów infekcji. Każda odmiana wymaga także odpowiedniego przygotowania stanowiska i stosowania biologicznych lub chemicznych środków ochrony roślin. Należy utylizować liście po cięciu oraz dotknięte pierwszymi objawami choroby.
Do jednej z poważniejszych chorób drzew iglastych zaliczyć można fytoftorozę, która skutkuje śmiercią drzewa. Aby wywołujący ją patogen nie dotknął pozostałych roślin, konieczne jest wycięcie i spalenie drzewka. Środkami zapobiegawczymi tej i innych chorób iglaków są m.in.: obfite podlewanie jesienią i zimą przy temperaturze powyżej 0˚C, średnie zagęszczenie drzew, stosowanie nawozów azotowych przed sezonem letnim, unikanie sadzenia przy gruszy, brzozie, modrzewiu, jodle – te zwiększają ryzyko wystąpienia chorób.
Najlepszą porą na wykonywanie zabiegów pielęgnacyjnych wszystkich roślin jest wczesna wiosna. Pierwsze czynności można podjąć już w marcu. Jednak ważniejsze od określenia konkretnego miesiąca są warunki pogodowe w danym dniu:
Zimą natomiast należy zabezpieczyć pnie małych drzew przed mrozem. Można do tego użyć np. wikliny, słomy lub maty trzcinowej. Uszkodzenia mechaniczne wpływają na odporność roślin.